Más mierda que recopilo de la red. A mi también me resultó molesto esto en un primer momento, y encontré cómo cambiarlo poniendo simplemente "cambiar botones ventanas" en el Google, sin ni siquiera especificar la palabra "Ubuntu"...xD
1º: Pulsamos Alt+F2 para acceder al ejecutador de aplicaciones, y escribimos gconf-editor y le damos a ejecutar.
2º: En la parte izquierda de la ventana que nos aparece buscamos apps/metacity/general. Lo pulsamos, y en la ventana de la derecha buscamos BUTTON_LAYOUT, y hacemos doble clic.
3º: En Valor escribimos menu:minimize,maximize,close
4º Y ya está :)
Espero que os haya resultado útil. ¡Saludos!